U III. gimnaziji izvodi se nastavni program prirodoslovno-matematičke gimnazije.
Program prirodoslovno-matematičke gimnazije izvodi se u tri inačice (A program, B program i C program). Broj nastavnih sati u prve dvije godine jednak je za pojedine predmete.
Za učenike koji žele pohađati fakultativnu nastavu nudimo sljedeće izborne predmete: Deutsches Sprachdiplom (DSD), Francuski jezik, Likovna umjetnost, Glazbena kultura.
Osnovne su razlike u inačicama u broju sati u predmetima: Matematika, Informatika i drugi strani jezik. Kao drugi strani jezik nudimo Njemački jezik i Talijanski jezik.

Program A – dva strana jezika (jedan obvezni i jedan izborni)
Program B – jedan strani jezik i izborna nastava Matematike
Program C – jedan strani jezik i izborna nastava Informatike